per Januar 2020 oder nach Vereinbarung zunächst befristet für 1 Jahr, es ist aber geplant die Position bei entsprechendem Auftragsvolumen zu entfristen
Ihre Hauptaufgaben
- Mitarbeit in der Bioinformatik eines NGS-Labors in der molekularen Tumordiagnostik
- Analyse von NGS-Daten (Illumina Plattform), Targeted Panel Sequencing, Whole Exome Sequencing (WES), Whole Genome Sequencing (WGS) und Interpretation von Mutationsdaten
- Enge Zusammenarbeit mit dem Laborpersonal bei der Laborautomation
- Integration der Schnittstelle zwischen dem bestehenden Sample Tracking (PathoPro) und dem NGS Workflow
- Weiterentwicklung einer Datenbank für die Analyse von NGS-Daten und Venetzung mit klinischen Patientendaten
- Sicherstellung der IT-Qualitätsstandards für ein diagnostisches Labor
- Möglichkeit zu wissenschaftlichem Arbeiten und Unterstützung von WGS-Projekten
- Erstellung von Patientenberichten aus dem molekularen Tumorprofiling
Ihr Profil
- Abgeschlossenes Studium der (Bio-) Informatik oder einer vergleichbaren Fachrichtung, Promotion wünschenswert
- Vertiefte Kenntnisse in Cancer Genomics und öffentlichen Genom/Protein/Tumor-datenbanken
- Mindestens 2 Jahre Erfahrung im Umgang mit relationalen Datenbanken (SQL)
- Erfahrung im Umgang mit NGS Daten, dem Aufbau eines NGS-Workflows und der Arbeit mit Illumina Sequenziergeräten sind Vorraussetzung
- Praktische und fundierte Kenntnisse in den gängigen Skriptsprachen (beispielsweise PHP, Python, JavaScript, oder Perl)
- Erfahrung mit UNIX und High Performance Computing Umgebungen
- Sehr gute Kenntnisse in aktuellen Webtechnologien (beispielsweise HTML5, jQuery, CSS) und Machine Learning
- Sehr gute Deutschkenntnisse und verhandlungssicheres Englisch sind Vorraussetzung
Unser Angebot
Wir bieten Ihnen eine vielseitige Aufgabe in einer fortschrittlichen Arbeitsumgebung, welche geprägt ist von hoher Qualität, Selbständigkeit, Flexibilität und Verantwortungsbewusstsein. Sie erhalten die Möglichkeit, gezielte Weiterbildung in Anspruch zu nehmen. Ein motiviertes und engagiertes Team unterstützt Sie dabei in allen Belangen. Mehr
Über das USZ
Das UniversitätsSpital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8000 Mitarbeitenden setzen sich täglich für das Wohl unserer Patienten ein. Mehr als 42300 stationäre Patientinnen und Patienten und rund 630000 ambulante Konsultationen pro Jahr zeugen von dem grossen Vertrauen in das USZ und seine Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter. Bei uns finden Sie ein attraktives und herausforderndes Umfeld für Ihr Wissen und Können.
Wir bieten das gesamte Spektrum der morphologischen Diagnostik (Analyse von Gewebeproben) an. Auch für Aus-, Weiter- und Fortbildung auf dem Gebiet der Pathologie sind wir zuständig. Das Institut besteht aus den Abteilungen Histopathologie/Autopsie, Zytopathologie, Pädopathologie, Insitu-Techniken sowie diagnostische Molekularpathologie. Ein Schwerpunkt unseres Instituts ist die klinisch orientierte Forschung mit molekularen Methoden. Mehr
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